慕容紫英在神魔之井关闭后，选择留在蜀山重振剑派。他继承了青索剑，成为蜀山新一代掌门，继续守护人间和平。

韩菱纱在神魔之井中获得了伏羲琴，成为伏羲后裔的传承者。她回到青鸾峰，将伏羲琴传授给后人，延续了伏羲一族的力量。

云天河和韩菱纱在通关后，并未明确提及他们的婚姻。不过，在《仙剑奇侠传5》的前传中，有暗示云天河和韩菱纱最终结婚，并育有两名子女。

《仙剑奇侠传4》中的景天，即《仙剑奇侠传1》中的李逍遥。在《仙剑奇侠传4》结尾，景天出现在蜀山，与云天河相见。他们之间的关系，在《仙剑奇侠传5》中进一步揭晓。

羲和与魔尊重楼约定，当人间面临浩劫时，重楼会出手相助。在《仙剑奇侠传5》中，重楼兑现了这一约定，帮助天界对抗魔界，保护人间。

韩菱纱的转世，在《仙剑奇侠传5》中出现，她名为姜承。姜承继承了韩菱纱的伏羲琴，并与云天河的后人携手，对抗魔界。

云天青在《仙剑奇侠传4》结尾，与神魔之井共存亡。不过，在《仙剑奇侠传5》中，他以魂魄形态出现，继续守护人间。他与云天河之间，有着重要的联系。